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朱载坖认为，可以借此事加强朝廷对于乌斯藏的控制，要使得朝廷重视有关活佛选拔的事情，在乌斯藏的政治生活中，宗教是很重要的一件事情，这些活佛在当地有非常大的影响力，这点即便是朱载坖这个皇帝也不得不重视，乌斯藏的政治和宗教联系是极为紧密的，所以朱载坖对于活佛的选任也要加强控制，以保证大明对于乌斯藏的控制。
这点朱载坖是很清楚的，所以朱载坖专门召见了礼部尚书陈经邦和大学士罗万化，他们都是善于处理外交和藩属问题的臣子，这次朱载坖要以索南加措的身后事为抓手，介入乌斯藏，理藩院要发挥应有的作用。要制定相应的规矩，重点在于朝廷直接参与对于活佛的择立，这点是朱载坖的意图。
罗万化等人当然也明白这个意思，朝廷要通过对于活佛选择的干预，加强对乌斯藏的控制，不过朝廷的干涉也要有度的，毕竟这些活佛和他们背后的宗教、土司势力在当地势力强劲，所以朝廷要达到一个平衡。
朝廷的目的是使得乌斯藏和内外蒙古的喇嘛教互不统属，而都辖于朝廷，犹江汉朝宗于海，加强对于蒙古和乌斯藏的控制，同时对于地方势力加以抑制，在羁縻的基础上逐渐增加朝廷的影响力。
说白了，就是要在喇嘛教内部建立起一套在国家控制之下的选拔宗教首领继承人的领导人选拔制度。说白了就是一种集权，朱载坖认为，要实施金瓶掣签制度，其实就是加强集权，将原本依附于地方势力的宗教集团，以金瓶掣签制度为纽带，集中到了朝廷的掌控之下，罗万化等人也充分理解了朱载坖的意图，不管是朱载坖提出的金瓶掣签还是之前朝廷所设想的一系列方案，都是方式的不同罢了，本质上都是加强朝廷的控制力罢了。
朱载坖所提出了金瓶掣签制度，其实也就是对于这些地方宗教势力加以管理的手段罢了，按照朱载坖的想法，金瓶掣签的第一步一样是寻访转世灵童，朱载坖在和理藩院以及相关的重臣们商量之后认为，在这一步应该重视尊重当地的风俗，朝廷不过多的干涉，这样的话，可以尽可能的减少当地对于朝廷政策的抗拒。
而在具体的选择转世灵童的候选人中，朝廷不多加以干涉，而是充分尊重乌斯藏本地的风俗，一般由当地的髙僧通过诵经祷祝观察天象等等宗教仪式，得到一个神谕，指示出转世灵童所在地的方位。然后再通过对所指示的方位某一自然景观，建筑物等进行进一步的观察，得出转世灵童所在地的具体信息。而在寻到转世灵童的候选人之后，必须让灵童对转世活佛生前所用法器等物进行辨认以确认是否有灵性参加掣签。
具体到金瓶掣签本身，由内官监制造以用于选择转世灵童的金瓶，由朱载坖赐予理藩院，而理藩院则是负责进行金瓶掣签的主要部分，按照罗万化等人所制定的规则，参与金瓶掣签的有理藩院官员、当地的朝廷最高军政长官、土司头人、还有宗教领袖，在所有人的见证之下经过宗教仪式选出相应的转世灵童。
按照罗万化等人所设计的办法，所有人到齐之后，先将寻访出的灵童生辰分别用蒙、汉、藏文写
